Vergi uyuşmazlığı, vergi idaresiyle mükellefler arasında vergilendirme dolayısıyla ortaya çıkan hukuki nitelikteki uyuşmazlıklardır. Vergi ihtilafı olarak da adlandırılır.

Vergi uyuşmazlığı vergilendirme işleminin aşağıdaki aşamalarından biriyle ilgili olarak ortaya çıkabilir:

1- Vergiyi doğuran olay
2- Mükellefiyet
3- Verginin tarhı
4- Verginin tahakkuku
5- Verginin tebliği
6- Ceza kesme
7- Tahsil işlemleri
8- Diğer vergi uygulamaları.